ウィルス系は陣営関係なく使えますよ。
でも、一度使用したポータルは1時間は使用できないとか
使うポータルのLv　×　1,000XMが必要なので高いLvのポータルに使う場合は自分の持ちXMの関係上使えない場合があるとかあるらしいです。
XMがマックスの状態でも自分のLv+1ぐらいのポータルまでしか使えないみたいです。