明石全登に限らず、戦国武将の読みなんて由来が分からないのが多いですよね。たとえば大友義統とか立花統虎の「統」はムネって読みますが、この字を人名以外でムネって読む言葉は無いように思います。（もしかしたら当時には用例があったのかもしれませんが）
でも、現代でも読める人は大勢いるわけで。大友家における統＝ムネの場合は義統からの偏諱って想像できるからというのもありますが、要は前例があるから、その一点に過ぎないでしょう。
なので、「読みの一部を使う」「漢字から色々連想」「ワイルドカード」あたりの命名法を使われる方は、自ら前例を作る覚悟と気概を持って臨んでいただければと思うのです。
そのうち他に賛同する人が増えていって、名前の読みとして定着する可能性も無くはないでしょうし。