＞Amazonしか交換したことないけど、
＞楽天とアマゾンのポイントにはどんな違いがあるんだろう？
＞楽天だけ廃止って不思議だ。
　
あくまでも推測ですが、楽天での交換は電子マネーで、amazonでの交換は商品券（ギフトカード）扱いになるんじゃないでしょうか？
電子マネー同士（はてなポイント→楽天スーパーポイント）の交換では資金決済法の適用を受けますが、アマゾンギフトカードの交換については、アマゾンとの売買になるので、資金決済法の適用外になると思います。
現に、楽天スーパーポイントの購入はできませんが、アマゾンギフトカードはアマゾンのサイトやコンビニで購入できます。