>僕の試案は「無料質問には制限ありき」でスタートしましたが、そもそも無料質問を登録することの制限の是非についてはどう考えますか？

私も無料質問には何らかの制限を付けるべきだと思います。
（無料質問の連続投稿の制限・無料質問の月間投稿回数の制限・無意味な質問や人気投票の禁止など）
ただし、今の段階で上記の様な制限をかけると、うごメモユーザーを中心に反発が予想されますので、ある程度の調整や告知期間を設けるなどして、ソフトランディング的解決をめざすべきだと思います。