医療機関に対する苦情・相談は、管轄の保健所（例 大阪府 http://www.pref.osaka.jp/suitahoken/kikaku/iryou-soudan.html）で受け付けてもらえます。
また、人権侵害については管轄の法務局（法務省人権擁護局）にも相談窓口があるので、そちらに相談されてもいいと思います。
（人権擁護局のHPからメールでの相談ができます。）

人権を侵害されたら（人権侵害の被害を受けた方へ）
法務省・人権擁護局