紅葉はまだでしょうねぇ。
早朝の伏見稲荷とかどうですか。そのあと足を延ばして平等院まで行けるかも。
いつも激混みな清水寺も早朝ならゆっくり回れそうです。6時から拝観できるとか。
"早朝 京都"でGoogle検索すると色々出てきます。
ハイクの京都キーワードも参考になるかもしれません。