地下に鉄道を敷くときに、すでにある埋設物をなるべく移動しないように済むようにします。たとえば銀座線より後に作られた東西線は、日本橋駅では銀座線より低い位置にあります。で、丸ノ内線よ総武快速線を敷いたときに、すでに東京駅には営団の丸ノ内線があってその下をくぐるように敷きました。
で、京葉線なのですが、基本的に京葉線は京葉コンビナート地帯から舞浜を経て、新木場、お台場を経て大井ふ頭方向へ抜ける貨物線として計画をたてて、そのあと(殺人的に混む総武快速線と東西線のラッシュを考慮したのかどうかはわかりませんが）旅客線に計画を変更し、新木場から東京駅につなげようとしたんすが、すでに東京駅周辺はいろんなものが埋設済みですからいかんともしがたく、比較的地表に近いところに駅を作れる有楽町よりの位置に駅を作った状態です。
もうちょっと便利になればいいんすが、こればっかりはどうしようもないのかもっす。